Theo báo cáo của Tổng cục Thuế, tính đến ngày 7/12/2017, cơ quan Thuế các cấp đã thực hiện 90.021 cuộc thanh tra, kiểm tra (đạt 99,12% kế hoạch năm 2017). Tổng số thuế tăng thu qua thanh tra, kiểm tra là hơn 16.925 tỷ đồng. Trong đó giảm khấu trừ là 1.523 tỷ đồng; giảm lỗ là 32.092 tỷ đồng. Từ đó, số tiền thuế nộp vào ngân sách là 12.493 tỷ đồng, đạt 73,81% số thuế tăng thu qua thanh tra, kiểm tra.

Theo báo cáo, số DN được thanh tra là 6.638 DN, đạt 92,21% kế hoạch năm 2017. Tổng số truy thu, truy hoàn, phạt là 10.017 tỷ đồng. Qua thanh tra trước hoàn thuế giảm số chi hoàn thuế từ ngân sách nhà nước số tiền là 400 tỷ đồng với số đã nộp ngân sách là hơn 8.000 tỷ đồng.

Về kiểm tra, số DN được kiểm tra là 83.383 DN, đạt 99,72% kế hoạch năm 2017. Tổng số truy thu, truy hoàn, phạt là 6.450,04 tỷ đồng. Số đã nộp ngân sách là 3.900 tỷ đồng.

Toàn ngành Thuế cũng đã tiến hành kiểm tra hồ sơ khai thuế tại trụ sở cơ quan Thuế đối với 940.523 hồ sơ. Từ đó xử lý điều chỉnh thu vào ngân sách 458 tỷ đồng. Qua kiểm tra rà soát các hồ sơ khai thuế tại cơ quan Thuế đã phát hiện những sai sót, ẩn lậu của người nộp thuế để điều chỉnh tăng số thuế kê khai hoặc ấn định thuế.

Riêng đối với việc thanh tra, kiểm tra các DN có hoạt động giao dịch liên kết, báo cáo cho thấy trong 10 tháng đầu năm 2017 đã tiến hành thanh tra, kiểm tra được 301 DN có hoạt động giao dịch liên kết, qua đó đã truy thu, truy hoàn và phạt hơn 1.000 tỷ đồng. Từ đó điều chỉnh tăng thu nhập chịu thuế 2.558 tỷ đồng. Trong đó thanh tra, kiểm tra xác định lại giá thị trường đối với giao dịch liên kết đã truy thu 452 tỷ đồng; điều chỉnh tăng thu nhập chịu thuế 2.448 tỷ đồng.

Theo Tổng cục Thuế, mục tiêu kế hoạch thanh tra, kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế năm 2018 của các cục thuế phải đạt tối thiểu 18,5% số lượng người nộp thuế đang hoạt động thuộc diện quản lý thuế (trong đó kế hoạch thanh tra đạt tối thiểu 1%).

Tổng cục Thuế cũng yêu cầu các cục thuế căn cứ vào chỉ tiêu mà ngành Thuế đã đề ra và tình hình thực tế quản lý DN để chủ động giao cho các đơn vị tỷ lệ và số lượng DN phải thực hiện thanh tra, kiểm tra.

Tổng cục Thuế quy định, số lượng người nộp thuế đang hoạt động để tính 18,5% là số lượng DN đang hoạt động được quản lý thuế trên hệ thống đăng ký thuế tại ngày 31/12/2016.

Kế hoạch thanh tra, kiểm tra năm 2018 sẽ được loại trừ các đơn vị như: Đơn vị hành chính sự nghiệp, cơ quan nhà nước, các văn phòng đại diện; các chi nhánh DN hạch toán phụ thuộc trong cùng địa bàn; các DN được thành lập trước năm 2016 nhưng chưa phát sinh doanh thu và chi phí hoặc ngừng nghỉ kinh doanh đến 30/9/2017 chưa hoạt động trở lại; các DN mới thành lập trong năm 2016.

Theo Tổng cục Thuế, năm 2018 ngành Thuế sẽ tập trung thanh tra, kiểm tra các DN thuộc ngành nghề, lĩnh vực có dư địa thu lớn như: Dầu khí, xăng dầu, hàng không, dược phẩm; các tổ chức tín dụng; kinh doanh du lịch, khách sạn, nhà hàng, casino, công ty xổ số; DN phát sinh chuyển nhượng vốn; DN có giao dịch liên kết; DN bất động sản lớn; DN có hoạt đông khai thác khoáng sản...

Đặc biệt, ngành Thuế sẽ chú trọng thanh tra thuế đối với DN hoạt động ở các ngành nghề kinh doanh mới, đặc thù phải kê khai thuế như: Kinh doanh qua mạng; hoạt động kinh doanh dịch vụ vận tải Grab, Uber; bán hàng đa cấp…

Ngoài ra trong công tác thanh tra, kiểm tra hoàn thuế Giá trị gia tăng sẽ tập trung thanh tra kiểm tra với các DN có rủi ro cao về hóa đơn, có hoàn thuế lớn, phát sinh hoàn thuế bất thường và các DN hoàn thuế giá trị gia tăng hàng xuất khẩu qua biên giới đất liền.

Tổng cục Thuế cũng lưu ý các cục thuế khi xây dựng thanh tra, kiểm tra trên nguyên tắc rủi ro, cần lưu ý tới những DN nhiều năm chưa được thanh tra, tránh tình trạng hiện nay có DN cơ quan Thuế năm nào cũng thanh tra kiểm tra và có DN nhiều năm chưa được thanh tra, kiểm tra.